Godzilla 90’s Probablement l'incarnation la plus populaire de Godzilla. La version de l’ère Heisei de Godzilla est de retour dans ce jeu, toujours nommé Godzilla 90’s.
	Godzilla 2000 Bien que moins populaire que ses homologues Showa et Heisei, il a vraiment l'avantage d'être dans le Godzilla le plus récent qui est sorti aux USA.
	Anguirus Un favori des fans et un personnage déjà disponible dans Godzilla: Destroy All Monsters Melee. Cette version d’Anguirus est la version Showa.
	Baragon Malgré le fait que c’est la version de GMK qui est disponible dans le jeu, Baragon dispose également de son célèbre rayon de chaleur qu’il utilisait dans Frankenstein Conquers the World.
	Destroyah Lent, mais cependant puissant, Destroyah est de retour dans le jeu. Il s’agit en grande partie de la version du précédent jeu qui a été réutilisée.
	Gigan Un des ennemis les plus populaires de Godzilla, même avant son relooking pour Godzilla: Final Wars. Gigan était immensément populaire dans le premier jeu et son retour dans Godzilla: Save the Earth était prévisible.
	Jet Jaguar Il apparaîtrait que les questions de droits sur le personnage, quant à sa ressemblance avec Ultraman, ont été résolues avec Tsuburaya. Ce qui fait que ce monstre apparaît dans le jeu, pour le plus grand bonheur des fans des premiers Godzilla.
	King Ghidorah Cette version de King Ghidorah est de nouveau un mélange des plusieurs incarnations de King Ghidorah, comme dans Godzilla: Destroy All Monsters Melee.
	Mecha King Ghidorah Un autre personnage déjà visible dans Godzilla: Destroy All Monsters Melee, Mecha King Ghidorah a une liste de mouvement légèrement allongée par rapport à sa version précédente.
	Mecha Godzilla #2 Mis en évidence dans les annonces pour Godzilla: Destroy All Monsters Melee, l'inclusion de Mecha Godzilla #2 dans la suite n'est pas très surprenante.
	Mecha Godzilla #3 Le monstre géant mécanique construit à partir des os du premier Godzilla est de la partie.
	Megaguirus Grâce au fait que le film Godzilla Vs. Megaguirus est sorti aux USA peu de temps avant le jeu, il semblait logique qu’il fasse une apparition dans le jeu.
	Megalon Un personnage favori de fans, qui semble avoir frappé fort pour être disponible. Après ses apparitions dans Godzilla: Destroy All Monsters Melee et Godzilla: Domination, l'inclusion de Megalon dans ce jeu n’est pas une surprise.
	M.O.G.E.R.A. Modelé d’après la version Heisei, M.O.G.E.R.A. est aussi jouable dans un niveau bonus où il doit naviguer dans un champ d’astéroïdes avant de combattre la forme volante de Space Godzilla.
	Mothra Au début du jeu, le joueur joue avec la larve de Mothra, puis il peut la faire évoluer quand il le désire. La forme adulte de Mothra est celle de l’ère Heisei.
	Orga Le monstre « super-secret » du jeu précédent, Godzilla: Destroy All Monsters Melee, Orga revient ici en tant que monstre lent mais plein de ressources.
	Rodan Une des créations les plus célèbres de la Toho, Rodan est de retour et reprend le rôle qu’il avait déjà dans Godzilla : Destroy All Monsters Melee. Comme auparavant, le Rodan montré ici est celui de l’ère Heisei.
	Space Godzilla Un monstre que beaucoup de fans attendaient. Space Godzilla était un de premier monstre à être confirmé pour ce jeu.
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